Lander E.S., Waterman M.S. (eds.) — Calculating the Secrets of Life: Applications of the Mathematical Sciences to Molecular Biology :: Электронная библиотека попечительского совета мехмата МГУ

Главная Ex Libris Книги Журналы Статьи Серии Каталог Wanted Загрузка ХудЛит Справка Поиск по индексам Поиск Форум

Авторизация

Поиск по указателям

Lander E.S., Waterman M.S. (eds.) — Calculating the Secrets of Life: Applications of the Mathematical Sciences to Molecular Biology

Обсудите книгу на научном форуме

Нашли опечатку?
Выделите ее мышкой и нажмите Ctrl+Enter

Название: Calculating the Secrets of Life: Applications of the Mathematical Sciences to Molecular Biology

Авторы: Lander E.S., Waterman M.S. (eds.)

Аннотация:

In this first-ever survey of the partnership between mathematics and biology, leading experts look at how mathematical research and methods have made possible important discoveries in biology. Explores how differential geometry, topology, and differential mechanics have allowed researchers to "wind" and "unwind" DNA's double helix to understand the phenomenon of supercoiling. Explains how mathematical tools are revealing the workings of enzymes and proteins. Describes how mathematicians are detecting echoes from the origin of life by applying the stochastic and statictical theory to the study of DNA sequences.

Язык:

Рубрика: Биология/

Статус предметного указателя: Готов указатель с номерами страниц

ed2k: ed2k stats

Год издания: 1995

Количество страниц: 285

Добавлена в каталог: 30.11.2005

Операции: Положить на полку | Скопировать ссылку для форума | Скопировать ID

Предметный указатель

Sequence similarity, heuristic algorithms      82—84
Sequence similarity, in evolutionary analysis      57—58 72—73 76 90—94 106—112 115
Sequence similarity, K-best alignments      76—78
Sequence similarity, local alignment      5 65—70 99—106
Sequence similarity, multiple alignments      73—76
Sequence similarity, parallel computing      79—81 84 87
Sequence similarity, sublinear      84—86
Sequence tagged sites (STSs)      46 47—53
Sequencing methods and technology      13 17 19 26 81
Sequencing methods and technology, error detection and correction      73
Sequencing methods and technology, shotgun method      43—44
Sex chromosomes      26
Shotgun method      43—44
SIMD (single-instruction, multiple-data) computers      80
Site-specific recombination      207—212 222—225
Smith — Waterman algorithm      66 68 83 84 109
Solvent-accessible contact areas      252—253
SOS genes, response      183 198—199 200
Statistics of coverage      46—51
Stochastic processes      26 48
Stochastic processes, coalescent structures      119—135 148—149
Stochastic processes, combinatorial structures      119 136—148
Stochastic processes, likelihood methods      146—148
storage capacities      see “Computing time and memory capacity”
Strand separation and energy states      154 180 182 186—195
Strand separation and site prediction      184—186 196—200
Strand separation and unwinding      8 179—180 181—184 219—220
Stress responses      183 198—199 200 204
Strong law of large numbers, (SLLN)      97 98 100
Sublinear similarity searches      84—86
Sum-of-pairs scores      76
Supercoiling processes      153—163
Supercoiling processes, closed curves      153—154 155 156 157 181 204
Supercoiling processes, nucleosomes      154 174—177
Supercoiling processes, topoisomerase reactions      163—166 (see also “Strand separation and unwinding” “Superhelicity”)
Superheliciry      162 181—183 193
Surface linking number (Slk)      167—171 173—174

Synapsis      207—209 223—225 226—227
Systolic arrays      80—81 83—84
t-test      40—41
Tangles and knots      204—207 211 212—222
Tangles and knots, gel mobility      231—232
Tangles and knots, recognition      230—231
Tangles and knots, site-specific recombination models      222—225
Threading methods      248—254
Thymine (T)      8 99
Topoisomerase      164—166 175
topology      155 166—167 168 170—171 203—204 205 207 244 247
Topology of strand separation      180 181—184 219—220
Topology, surface linking number      167—171 173—174
Topology, tangles and knots      204—207 211 212—225 230—231
Toroidal surfaces      155 168 170 182 228—229 231
Traceback procedures      64
Transcription processes      9—12 154 179 196—198 204—205
transitions      117 185—186 188 190 194—195
Trivial tangles      218—219
tRNA (transfer RNA)      92 93 106 107 110—112
Twist (Tw)      157 159—160 162 164 173—174
Twist (Tw), topoisomerase reactions      164—166
Underwinding      154 164
Unit-cost scoring scheme      58—59 86
Unwinding      see “Strand separation and unwinding”
Uracil (U)      9 12
v-sis oncogene      58 91
Variable population size processes      148—149
Virtual surfaces      17—171
Vitalism      3
VLSI (very large scale integration) chips      80—81
Winding number      167 171—172 173—174
Writhe (Wr)      157 159 160 161 162 164
Writhe (Wr), topoisomerase reactions      164—166
X-ray crystallography      203 240
YAC (yeast artificial chromosomes) libraries      46—47 53
Z-DNA      154

1 2

О проекте