Второй том «Жизни пресных вод СССР» был подписан в печати накануне Великой Отечественной войны. Однако выйти в свет ему помешала фашистская бомба, разрушившая типографию, в которой находился набор книги. Теперь книга печатается в почти не измененном виде, по сохранившимся рукописям и корректурам.
Во втором томе «Жизни пресных вод СССР» описываются черви, мшанки, губки, кишечнополостные, простейшие, высшие растения, мхи, водоросли, лишайники, грибы и бактерии. Ввиду того, что многие из этих групп обладают большим количеством родов, авторам трудно было уложить свой материал в предоставленный им Редакцией листаж, и они написали статьи, значительно превышавшие намеченный объем. Не имея возможности увеличивать размер тома, Редакция была вынуждена произвести сокращение ряда статей. Особо сильному сокращению подверглись главы, написанные Г. Г. Щеголевым (пиявки), Н. С. Гаевской (простейшие), Н. Н. Вороникиным и Е. В. Шляпиной (водоросли) и В. П. Савичем (лишайники).
В этом томе, как и в первом, Редакция предоставляла относительно больше места группам, более актуальным для гидробиологов и в то же время наименее освещенным в русской литературе.
В 1941 году, незадолго до войны, скончались два автора второго тома Е. С. Неизвестнова-Жадина и проф. Я. Я. Никитинский, а за годы войны неумолимая смерть унесла членов редакционной коллегии акад. С. А. Зернова и проф. В. М. Рылова. В совсем недавние дни скончались проф. Б. А. Федченко и проф. Д. А. Ласточкин.