Несмотря на впечатляющие успехи медико-биологических наук прошлого столетия, в начале XXI века по-прежнему значимыми остаются классические детские инфекции — дифтерия, скарлатина, корь, краснуха, эпидемический паротит, коклюш, а также вирусные диареи, бактериальная дизентерия, сальмонел-лезы, ОРВИ.

Актуальной проблемой отечественной инфектологии в настоящее время является ВИЧ-инфекция, вирусные гепатиты с гемоконтактным механизмом заражения, глубокие микозы, герпесвирусные инфекции (цитомегаловирусная, инфекционный мононуклеоз, простой и опоясывающий герпес), хламидиозы и микоплазмозы.