Проблема общей зоологии — объяснение многообразия животного мира, признаваемого целостным объектом научного исследования. В I части книги это многообразие, единицей которого считают тип организации, выводится из многообразия межорганизменных (биологических) отношений. Во II части — таксономическая структура важнейшей группы животных — хордовых — рассматривается как результат морфофункциональной эволюции во взаимосвязи процессов адаптации и корреляции.