Основан в 1964 г.
Учредитель журнала – Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН
Периодическое издание «Новости систематики низших растений» выходит ежегодно с 1964 г. и является прямым продолжением серии «Ботанические материалы Отдела споровых растений Ботанического института АН СССР», основанной в 1922 г. как «Ботанические материалы Института споровых растений Главного ботанического сада РСФСР».
В ежегоднике наряду с описаниями новых таксонов и номенклатурными изменениями регулярно публикуются новые сведения о видовом разнообразии и распространении водорослей, грибов, лишайников и мохообразных – основополагающая информация для развития таксономии и систематики этих групп организмов.
Ежегодник широко известен и авторитетен как в России, так и за рубежом, он особенно востребован в странах бывшего СССР. В издании публикуются как известные и авторитетные, так и молодые ученые, студенты и аспиранты. В состав редакционной коллегии издания входят специалисты по споровым растениям и грибам. Все поступающие рукописи проходят обязательное рецензирование.